تختلف الكلمتان اختلافاً كلياً سواء بالمعنى أو اللفظ أو الجذر, وإليك تفصيلاً لكل منهما:
- ننفي تعبر عن فعل جمع أي نحن ننفي, والفعل المفرد منه هو نفى وجذره اللغوي
ن ف ي , وتأتي الكلمة بعدة معاني أبرزها الإنكار أي عكس الإثبات, وتأتي بسياق آخر مثل النفي من البلاد أي الاخراج منها والطرد وتمثل العقوبة.
- أما نفني تعبر عن فعل جمع أيضاً, بمفرد فنى وجذره اللغوي ف ن ي , والفعل مأخوذ من الفناء أي الهلاك والانعدام والزوال, أيضاً تأتي بسياق آخر مثل أفنى حياته لتربية أبناءه فتكون بمعنى أمضى أو كرس حياته وخصصها لهم.